Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms