Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFNP31947 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFNP31947 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFNP31947 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFNP31947 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFNP31947 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFNP31947 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFNP31947 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFNP31947 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFNP31947 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFNP31947 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFNP31947 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFNP31947 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms