Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP1P30622 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms