Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP1P29466 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP1P29466 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP1P29466 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP1P29466 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP1P29466 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP1P29466 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP1P29466 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP1P29466 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP1P29466 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms