Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms