Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms