Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTSSP25774 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTSSP25774 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms