Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms