Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPREP23469 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPREP23469 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPREP23469 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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