Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPI1P17947 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPI1P17947 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms