Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRF1P14222 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms