Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms