Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms