Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJB1P08034 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJB1P08034 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJB1P08034 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB1P08034 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB1P08034 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB1P08034 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB1P08034 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB1P08034 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB1P08034 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB1P08034 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB1P08034 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB1P08034 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB1P08034 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB1P08034 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB1P08034 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB1P08034 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB1P08034 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB1P08034 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms