Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSLP07711 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSLP07711 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSLP07711 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSLP07711 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSLP07711 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSLP07711 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSLP07711 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSLP07711 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSLP07711 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms