Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAPGEF3O95398 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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