Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HOXA3O43365 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HOXA3O43365 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HOXA3O43365 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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HOXA3O43365 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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