Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFS4O43181 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms