Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPDC1A2A3K4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPDC1A2A3K4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPDC1A2A3K4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPDC1A2A3K4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPDC1A2A3K4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPDC1A2A3K4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPDC1A2A3K4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPDC1A2A3K4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPDC1A2A3K4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPDC1A2A3K4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPDC1A2A3K4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPDC1A2A3K4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPDC1A2A3K4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPDC1A2A3K4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPDC1A2A3K4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPDC1A2A3K4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPDC1A2A3K4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms