Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms