Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms