Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms