Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms