Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
L1RE1Q9UN81 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms