Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBE1Q9UJT0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms