Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms