Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRPC4Q9UBN4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms