Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms