Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
XCL2Q9UBD3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms