Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
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