Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCC13Q9NSE7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms