Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms