Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms