Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms