Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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