Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms