Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms