Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms