Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms