Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLVAPQ9BX97 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms