Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms