Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms