Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTTNBP2Q8WZ74 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTTNBP2Q8WZ74 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms