Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HJURPQ8NCD3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms