Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms