Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225Q6GV28 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms