Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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