Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZK1Q5T2W1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZK1Q5T2W1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZK1Q5T2W1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZK1Q5T2W1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZK1Q5T2W1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZK1Q5T2W1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZK1Q5T2W1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDZK1Q5T2W1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZK1Q5T2W1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZK1Q5T2W1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZK1Q5T2W1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZK1Q5T2W1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDZK1Q5T2W1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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