Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms