Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BOLA3Q53S33 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms